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Eyewire publicontrata el mapeo de la conectoma retinal


El ojo tiene su propia conectoma, la red neuronal de la retina que procesa las señales entrantes antes de enviárselas al cerebro. Todavía se desconoce gran parte de su estructura y ahora los investigadores están recurriendo a la publicontratación para procesar las grandes cantidades de información que tienen de esta estructura. Eyewire, desarrollada por neurocientíficos del MIT, cuenta con un juego que requiere que los jugadores conecten las neuronas en una pequeña porción de la retina.
 
La información para el análisis consiste en un volumen de la retina con un tamaño de 350 × 300 × 60 μm3 que fue fotografiado usando microscopía electrónica de serie en el Instituto Max Planck para la Investigación Médica en Heidelberg, Alemania. En total asciende a cerca de un terabyte de datos. Aunque el análisis de estas imágenes para encontrar conectomas se pueden automatizar en cierta medida, mucho de ello sigue siendo trabajo manual y esto toma mucho tiempo. Mediante la incorporación de un elemento tipo juego y la participación de una multitud de todas partes del mundo, los investigadores esperan acelerar sus análisis.
 
El juego en sí es bastante simple: requiere que coloree las imágenes de la retina con el fin de mapear las conexiones. No requiere ningún conocimiento especializado. En la actualidad se trata de localizar y reconstruir las neuronas individuales. En una etapa posterior se introducirá otro juego que mapee las sinapsis con el fin de completar la conectoma. Finalmente, los investigadores esperan que sea lo suficientemente potente como para aplicarla al cerebro, a fin de detectar conexiones neuronales aberrantes que podrían ser responsables de ciertos trastornos, como el autismo y la esquizofrenia.
 
Le presentamos una entrevista por video con Sebastian Seung, profesor de neurociencia computacional en el MIT y líder del proyecto Eyewire: GigaOM…

Página web: Eyewire…

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Illumina lanza una aplicación para el iPad llamada MyGenome para visualizar el genoma humano

Illumina ha puesto en marcha la aplicación MyGenome para el iPad, una aplicación que visualiza el genoma humano. Esta aplicación le permite explorar un genoma humano real y ver los informes sobre variaciones genéticas importantes. En su versión actual actúa principalmente como una herramienta educativa; sin embargo, Illumina prevé una versión futura que se convierta en una herramienta clínica para que los médicos la utilicen con sus pacientes para mejorar la comunicación de los datos genéticos.

La aplicación dispone de un genoma real, un mapa del genoma, tarjetas de salud e informes y un vídeo-viaje dentro del genoma. El genoma incluído pertenece a Jay Flatley, director ejecutivo de Illumina, Lo más interesante sin embargo, es que en versiones futuras, usted podrá explorar su propio genoma después de que se lo haya secuenciado el servicio de secuenciación del genoma individual de Illumina Illumina tiene previsto entregarle primero los datos genéticos al médico que los ordena a través de la aplicación, permitiéndole el acceso directo al consumidor sólo después de que el médico haya analizado el resultado con el consumidor. La aplicación está disponible por $0.99 a través de la App Store de Apple.

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El corazón cuantificado (video)  

Hemos estado siguiendo de cerca el movimiento auto cuantificado desde hace unos años como una tendencia relacionada a la tecnología médica/de bienestar que algún día podría conectarse a una asistencia sanitaria más personalizada. El movimiento ha sido posible gracias a la amplia gama de consumidores de registro de datos, dispositivos médicos y sensores, que le permiten a las personas acumular y analizar datos de muchos aspectos de sus vidas, desde la productividad hasta los patrones de sueño.

El equipo en el blog de auto-cuantificación (Quantified Self Blog) ha sido una fuerza importante en la promoción de este movimiento y acaba de publicar un vídeo de presentación de un gran auto-seguidor médico, el Dr. Mark Drangsholt. Mark enseña la medicina basada en la evidencia en la Universidad de Washington y habla a través de una serie de experimentos de auto-seguimiento que lleva a cabo para poder manejar su condición cardíaca. Lo que es particularmente interesante de esta charla es cómo Mark describe el movimiento de auto-cuantificación en el contexto de la medicina y la toma de decisiones clínicas basadas en la evidencia.

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La genómica clínica de IBM ayuda a tomar las decisiones clínicas

IBM Research – Haifa, Israel,ha desarrollado una nueva herramienta de apoyo a la decisión clínica que relaciona el perfil único de la enfermedad de un paciente frente a varias directrices clínicas, con una amplia gama de información clínica adquirida previamente de un gran número de pacientes. La herramienta, llamada genómica clínica (CLI-G), está diseñada para proporcionarle a los médicos los resultados que esbozan cómo abordar las condiciones individuales de los pacientes.

El sistema está siendo probado actualmente en la Fondazione IRCCS Istituto Nazionale dei Tumori, un centro en Italia de investigación y tratamiento contra el cáncer .

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P&R: Cómo Central Logic y HP pueden ayudar a los hospitales a mejorar el flujo de pacientes  

El mes pasado, HP anunció que Central Logic Core, un sistema para la gerencia de las camas de pacientes desarrollado por la compañía Central Logic, Inc. basada en Utah, se integrará y se venderá exclusivamente con el hardware de HP, incluyendo HP Z Workstations y monitores HP de pantalla táctil, para ayudar a los hospitales a “optimizar el cuidado de los pacientes, proporcionando la información completa del flujo de pacientes en tiempo real”. Medgadget tuvo la oportunidad de preguntarle a Matt Meservey, gerente de productos de Central Logic, algunas preguntas sobre el sistema y la nueva asociación:

Medgadget:¿Puede decirnos cómo podrían beneficiarse los hospitales de la integración de las estaciones de trabajo HP Z600 con el sistema de manejo del paciente basado en la web del núcleo de Central Logic?

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Symcat estudia sus síntomas con ayuda de la información  

“Big data” (información voluminosa, veloz y variada) es la frase que tiene alborotadas a las industrias de alta tecnología y de asistencia sanitaria. La capacidad de recopilar y analizar inteligentemente los datos del paciente, desde la secuencia del ADN hasta sus signos vitales, promete revolucionar tanto la prestación de la asistencia sanitaria como la comprensión del cuerpo humano. La integración de la información de millones de pacientes puede que acelere mucho los descubrimientos de salud de la población, y que oriente las decisiones individuales de tratamiento. Esta fue una de las aplicaciones más interesantes del Watson de IBM, pero aún queda un largo camino por recorrer antes de que esta poderosa máquina esté a la disposición del sistema de salud, y mucho mas aún, al alcance del público en general.

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Software para el CDI predice tempranamente las fallas del dispositivo

Los investigadores del Instituto del Corazón de Minneapolis en el Hospital Abbott Northwestern en Minneapolis, Minnesota, informaron que un software disponible comercialmente para monitorear el cardioversor/desfibrilador implantable (CDI), podría identificar problemas con los CDI antes que las prácticas actuales de vigilancia.

Los dispositivos CDI modernos son capaces de detecciones sofisticadas y de técnicas de registro de datos que tienen como objetivo optimizar los tratamientos y el rendimiento del dispositivo de monitorización. Estos datos registrados pueden ser leídos fácilmente por un médico en un ambulatorio, utilizando un software actual para el monitoreo del CDI.  El estudio, que fue publicado en la revista Circulation: Cardiovascular Quality and Outcomes, tenía como objetivo determinar si estos datos ya existentes podrían ser utilizados para predecir mas tempranamente las fallas de los dispositivos.

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El F37: Nuevo sistema compacto de ultrasonido

Hitachi Aloka Medical presenta su nuevo sistema de ultrasonido de diagnóstico diseñado para usarse en entornos de atención primaria.

Parece que la empresa pretende comercializar el modelo F37 a los hospitales y clínicas de los países en desarrollo.

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Secuencia de nanoporos de ADN activada por USB por $ 900  

La secuencia de nanoporos se presenta como una técnica que revolucionará la genómica durante unos cuantos años, y parece que finalmente veremos resultados verdaderos y reales. Oxford Nanopore Technologies de Oxford en el Reino Unido, presenta sus dos sistemas para la secuencia del ADN, un sistema de alto rendimiento llamado GridION y un secuenciador en miniatura alimentado por USB llamado MinION. Ambos dispositivos aprovechan las técnicas patentadas de detección de nanoporos, tal como se explica en el vídeo a continuación.

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